2009年9月27日星期日

[PerlChina] Re: 在我遇到的这种情况下散列和数组哪个快?

是啊,4G内存算到12就是极限了。算13就会内存溢出。。。要算长字串的话还得看您那个的C++实现了,呵呵。。。

On 9月27日, 下午12时46分, agentzh <agen...@gmail.com> wrote:
> 2009/9/25 空格 <ribozyme2...@gmail.com>
>
> > 程序里用的还是一个散列,如前面各位说的,它对内存的消耗非常大。目前看,计算12核苷酸(12bp)长度的串使用了2G左右的内存。计算10bp串使
> > 用大约800M内存。我还没有算13bp的情况。truncatei 说的调整为整型的那个我还没有加上去。
>
> 这种容易组合爆炸的问题,最好还是不要用 Perl 了。。。Python/Ruby 应当也是类似的,呵呵。。。考虑到 Perl
> 散列底层的数据结构的实现,那个 RAM 占用太铺张了,哈哈!
>
> Cheers,
> -agentzh
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