2009年4月24日星期五

[PerlChina] Re: 编写提取染色体CDS的问题

我有现成的程序,从基因组的 chrxxx.gbk文件中提取基因和表达最长cds的序列及其注释信息。
你要什么基因组?我今天下午刚刚还在调试,现有人和鸡的基因组结果文件。
你要程序还是直接要跑完的结果?


On 4月23日, 下午8时52分, guo <sczz...@126.com> wrote:
> 我在windows上下载安装了activeperl,想编写给程序把人类染色体序列上的编码区也就是CDS给提取出来。有朋友说用bioperl模块
> 来编程效率更高。可是我不会用。自己试着使用ppm来安装bioperl也没有成功。
> 现在主要是想请教一下,有没有人会bioperl,或者activperl的,能不能帮我写一个程序来把人类染色体序列中的CDS提取出来。
> 染色体序列我已经从NCBI上下载下来了。就是不知道如何编写程序。请教高手。
> 即使程序付费,我也愿意。
> 希望广大perl友帮忙。
--~--~---------~--~----~------------~-------~--~----~
您收到此信息是由于您订阅了 Google 论坛"PerlChina Mongers 讨论组"论坛。
要在此论坛发帖,请发电子邮件到 perlchina@googlegroups.com
要退订此论坛,请发邮件至 perlchina+unsubscribe@googlegroups.com
更多选项,请通过 http://groups.google.com/group/perlchina?hl=zh-CN 访问该论坛
-~----------~----~----~----~------~----~------~--~---

没有评论: