2011年6月23日星期四

[PerlChina] Re: 请教一个关于蛋白质序列的 perl语言程序

谢谢大伙了・・・・・・・・・让这个沉下去吧

On 6月23日, 上午11时12分, xiumu <yangyang445...@126.com> wrote:
> FASTA是生物信息数据库的常用存储方式,了解FASTA格式的含义,用perl编写程序分离注释行内容,分离蛋白质序列,并转变成氨基酸三字母表示
> 方式。说明使用的perl数据结构和程序的变量转换过程,解释含义。
>
> 承认这是个作业・・・・・ 谢谢各位老大了・・・时间比较紧急 明天就交了・・・・・・ 程序于简单越好
>
> >1A23:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE >:注释行
>
> AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQA WAVAM
> ALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFV NGKYQ
> LNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK
> 数据内容>1AAR:B|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
>
> MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRG G>1AG2:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
>
> GLGGYMLGSAMSRPMIHFGNDWEDRYYRENMYRYPNQVYYRPVDQYSNQNNFVHDCVNITIKQHTVTTTTKGENF TETDV
> KMMERVVEQMCVTQYQKESQAYY>1AJ3:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
>
> AKLNESHRLHQFFRDMDDEESWIKEKKLLVSSEDYGRDLTGVQNLRKKHKRLEAELAAHEPAIQGVLDTGKKLSD DNTIG
> KEEIQQRLAQFVDHWKELKQLAAARGQRLE>1ARR:B|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
>
> MKGMSKMPQFNLRWPREVLDLVRKVAEENGRSVNSEIYQRVMESFKKEGRIGA

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