2009年10月30日星期五

[PerlChina] Re: 如何处理大的数据库文件

谢谢大家

2009/10/30 Haiyan Lin <linhy0120@gmail.com>
临时把 $/改成 “〉”,就可以一次读取一个 记录 (类似“〉。。”)的信息。然后去提取。
 
是个搞生物的。 可以去BioPerl看看有没有相关的模块。
----- Original Message -----
From: 陈晨
Sent: Thursday, October 29, 2009 10:42 PM
Subject: [PerlChina] Re: 如何处理大的数据库文件

>006L_IIV6        |============================================| Q91G88.1 352 a.a.
DUF3627          1                             ____________     (216) PF12299.1 Protein of unknown function (DUF3627)  231-324
KilA-N           1   _____________                              (1764) PF04383.6 KilA-N domain  19-126
就是这种格式,目的是提取Q91G88.1,PF12299.1,PF04383.6这样的数据。第一个是蛋,第二个是domain
2009/10/29 xsir317 <xsir317@163.com>
大概是什么样格式的东西?要进行什么处理?
 
 
2009-10-29


发件人: amsssky
发送时间: 2009-10-29  14:29:32
抄送:
主题: [PerlChina] 如何处理大的数据库文件
工作需要处理pfam上的数据,但是看到上面的数据文件很大,有1.8G,想知道用perl可以处理吗?如何处理?
 
2009-10-29

amsssky
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