[PerlChina] Re: 如何处理大的数据库文件

谢谢大家

2009/10/30 Haiyan Lin <linhy0120@gmail.com>

临时把 $/改成 “〉”，就可以一次读取一个 记录 （类似“〉。。”）的信息。然后去提取。

 

是个搞生物的。 可以去BioPerl看看有没有相关的模块。

----- Original Message -----

From: 陈晨

To: perlchina@googlegroups.com

Sent: Thursday, October 29, 2009 10:42 PM

Subject: [PerlChina] Re: 如何处理大的数据库文件

>006L_IIV6        |============================================| Q91G88.1 352 a.a.
DUF3627          1                             ____________     (216) PF12299.1 Protein of unknown function (DUF3627)  231-324
KilA-N           1   _____________                              (1764) PF04383.6 KilA-N domain  19-126
就是这种格式，目的是提取Q91G88.1，PF12299.1，PF04383.6这样的数据。第一个是蛋，第二个是domain

2009/10/29 xsir317 <xsir317@163.com>

大概是什么样格式的东西？要进行什么处理?

 

 

2009-10-29

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发件人： amsssky

发送时间： 2009-10-29  14:29:32

收件人： perlchina@googlegroups.com

抄送：

主题： [PerlChina] 如何处理大的数据库文件

工作需要处理pfam上的数据，但是看到上面的数据文件很大，有1.8G，想知道用perl可以处理吗？如何处理？

 

2009-10-29

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amsssky

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