[PerlChina] Re: 编写提取染色体CDS的问题

我现在不知道怎么弄的，只剩下Can't find any package that provide DB_File:: for Bundle-BioPerl-Core

这一个提示了，其他的都好了好像。

然后就是nmake这个东西好像没有装

在2009-04-23 23:36:35，xsir317 <xsir317@163.com> 写道：

C:\perl\>CPAN

 

cpan>install Bundle::BioPerl

 

然后折腾呀折腾呀。。。就好了

2009-04-23

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xsir317

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发件人： guo

发送时间： 2009-04-23  22:37:55

收件人： PerlChina Mongers 讨论组

抄送：

主题： [PerlChina] Re: 编写提取染色体CDS的问题

我安装bioperl时遇到的问题。在ppm search bioperl过后，输入ppm install bioperl后出现以下问题。

C:\Perl>ppm install bioperl

Downloading ActiveState Package Repository packlist...not modified

ppm install failed:

Can't find any package that provide XML-SAX-ExpatXS for Bundle-BioPerl-

Core

Can't find any package that provide GD:: for Bundle-BioPerl-Core

Can't find any package that provide DB_File:: for Bundle-BioPerl-Core

Can't find any package that provide GD:: for GD-SVG

On 4月23日, 下午8时52分, guo <sczz...@126.com> wrote:

> 我在windows上下载安装了activeperl，想编写给程序把人类染色体序列上的编码区也就是CDS给提取出来。有朋友说用bioperl模块

> 来编程效率更高。可是我不会用。自己试着使用ppm来安装bioperl也没有成功。

> 现在主要是想请教一下，有没有人会bioperl，或者activperl的，能不能帮我写一个程序来把人类染色体序列中的CDS提取出来。

> 染色体序列我已经从NCBI上下载下来了。就是不知道如何编写程序。请教高手。

> 即使程序付费，我也愿意。

> 希望广大perl友帮忙。

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