2009年4月23日星期四

[PerlChina] Re: 编写提取染色体CDS的问题

我安装bioperl时遇到的问题。在ppm search bioperl过后,输入ppm install bioperl后出现以下问题。
C:\Perl>ppm install bioperl
Downloading ActiveState Package Repository packlist...not modified
ppm install failed:
Can't find any package that provide XML-SAX-ExpatXS for Bundle-BioPerl-
Core
Can't find any package that provide GD:: for Bundle-BioPerl-Core
Can't find any package that provide DB_File:: for Bundle-BioPerl-Core
Can't find any package that provide GD:: for GD-SVG


On 4月23日, 下午8时52分, guo <sczz...@126.com> wrote:
> 我在windows上下载安装了activeperl,想编写给程序把人类染色体序列上的编码区也就是CDS给提取出来。有朋友说用bioperl模块
> 来编程效率更高。可是我不会用。自己试着使用ppm来安装bioperl也没有成功。
> 现在主要是想请教一下,有没有人会bioperl,或者activperl的,能不能帮我写一个程序来把人类染色体序列中的CDS提取出来。
> 染色体序列我已经从NCBI上下载下来了。就是不知道如何编写程序。请教高手。
> 即使程序付费,我也愿意。
> 希望广大perl友帮忙。
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