你可以把所有的读到一个数组中,每一行是数组的一个元素。
然后,你把这个数组处理一下,去掉数组中重复的元素。
然后,在把这个数组写回去,就行了呗。
2011/1/25 Fei Ni <nifei1998@gmail.com>:
> 本地BLAST之后的结果:
> ce_TREP251 ce_TREP251 100.00 200 0 0 1 200 1
> 200 1e-113 396
> ce_TREP200 ce_TREP200 100.00 200 0 0 1 200 1
> 200 3e-99 349
> ce_TREP1528 ce_TREP1528 100.00 200 0 0 1 200 1
> 200 1e-113 396
> ce_TREP821 ce_TREP1438 93.00 200 13 1 1 200 1
> 199 9e-78 278
> ce_TREP1438 ce_TREP821 93.00 200 13 1 1 199 1
> 200 9e-78 278
> ce_TREP821 cs_TREP3162 85.23 149 22 0 1 149 1
> 149 1e-30 121
> cs_TREP3162 ce_TREP821 85.23 149 22 0 1 149 1
> 149 1e-30 121
>
> 我想去掉其中的两种重复序列(1:1-3行,序列本身的BLAST结果;2:4-5行、6-7行,4和5 | 6和7是一样的结果,只保留一个就可以),
> 第一种很好去掉,但是第二种该如何去掉那(我在尝试着修改我的perl script,但到目前为止一直没有成功。。。)?
> 非常感谢!
> --
> Feiny
> Achieving dream takes time and patience.Great careers don't happen overnight
> ,and take years of hardwork.But every step along the road can get you closer
> to your dream.
>
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