Re: 一个基于位数组的序列覆盖率分析器 (Was Re: [PerlChina] Re: 在我遇到的这种情况下散列和数组哪个快？)

2009/9/25 空格 <ribozyme2004@gmail.com>

好象确实是这个大文件支持没有打开。正在研究perl解释器中，呵呵。
另外，还有一个小建议，就是可不可以加一个参数。把这个寡核苷酸串的长度设定成按照用户需求设定的一个值。

你可以在 parse_seq_file 中利用 tokens_seen 这个变量作读取长度的限制 :) 当然，

            if (tokens_seen < APPEARS_SEQSIZE) {
                tokens_seen++;
            }

须替换为

            tokens_seen++;

即无条件递增。

由于总共不到 200 行 C++ 代码，而且我在可读性上面下了些功夫，应该不难修改和调试的，呵呵。

Cheers,
-agentzh

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