2013年5月9日星期四

Re: [PerlChina] Perl程序在windows下运行成功,但在linux下却运行没有结果,请高手帮忙看下。

我看了perlport,觉得这两个地方可以改
1.你把open按照小骆驼上的写法来写。
2. 看看那个python程序对不对。



from my mobile device.

On May 9, 2013 11:23 PM, "Li Xiangchen" <lixiangchenxy@gmail.com> wrote:
嗯,是我程序写的太烂了,呵呵,我自己找小骆驼看看,谢谢您了。
在 Fri, 10 May 2013 12:22:27 +0800,Hao Wu <echowuhao@gmail.com> 写道:

底下的我看不懂了:)

from my mobile device.

On May 9, 2013 11:20 PM, "Li Xiangchen" <lixiangchenxy@gmail.com> wrote:
@M输出的结果是对的。
在 Fri, 10 May 2013 12:14:54 +0800,Hao Wu <echowuhao@gmail.com> 写道:

你只运行前几行看看@M对不对。

from my mobile device.

On May 9, 2013 11:13 PM, "Hao Wu" <echowuhao@gmail.com> wrote:

可能是chomp那个地方出了问题。windows的newlines chomp搞不定。

from my mobile device.

On May 9, 2013 9:46 PM, "Li Xiangchen" <lixiangchenxy@gmail.com> wrote:
下面是我写的程序,本人新手,代码写的乱,还请见谅。遇到的问题是在windows下运行成功,但在linux下却运行没有结果,请帮帮我!

use File::Copy ;

open(INPUT,"taxID.txt");

$i=0;
while (<INPUT>) {
        chomp($_);
        chomp($_);
        $M[$i] = $_;
        $i++;
}
$len=@M;

for ($i=0;$i<$len;$i++) {

        open(INPUT1,"417species_PPI.txt");
        open(OUTPUT1,">species_PPI.txt");

        my $species = $M[$i];

        mkdir($species,0755)||die "can't create directory: $!" ;

        print "Now it is ",$species," it is the ",$i," of these species,remains ",$len-$i," species.\n";

        while(<INPUT1>) {
                if ($_=~/^($M[$i])\.(.*)/){
                print OUTPUT1 $_;
                }
        }
        close(INPUT1);
        close(OUTPUT1);

        open(INPUT2,"species_PPI.txt");
        open(OUTPUT2,">species_PPI2.txt");

        while(<INPUT2>) {
                chomp($_);
                my@a=split/\s/;
                print OUTPUT2 "$a[0]\t$a[1]\n";
        }
        close INPUT2;
        close OUTPUT2;

        $system_check=system("python jisuan.py");

        open INPUT3,"degree_centrality.txt";
        open INPUT4,"closeness_centrality.txt";
        open INPUT5,"betweenness_centrality.txt";
        open INPUT6,"clustering_coefficient.txt";
        open OUTPUT3,">degreenew_centrality.txt";
        open OUTPUT4,">closenessnew_centrality.txt";
        open OUTPUT5,">betweennessnew_centrality.txt";
        open OUTPUT6,">clusteringnew_coefficient.txt";

        while (<INPUT3>) {
                s/{(.*)}/$1/g;
                s/\s//g;
                s/,/\n/g;
                s/'(.*)'\:(\d+)/$1\t$2/g;
                print OUTPUT3 $_,"\n";
        }
        close INPUT3;
        close OUTPUT3;
        while (<INPUT4>) {
                s/{(.*)}/$1/g;
                s/\s//g;
                s/,/\n/g;
                s/'(.*)'\:(\d+)/$2/g;
                print OUTPUT4 $_,"\n";
        }
        close INPUT4;
        close OUTPUT4;
        while (<INPUT5>) {
                s/{(.*)}/$1/g;
                s/\s//g;
                s/,/\n/g;
                s/'(.*)'\:(\d+)/$2/g;
                print OUTPUT5 $_,"\n";
        }
        close INPUT5;
        close OUTPUT5;
        while (<INPUT6>) {
                s/{(.*)}/$1/g;
                s/\s//g;
                s/,/\n/g;
                s/'(.*)'\:(\d+)/$2/g;
                print OUTPUT6 $_,"\n";
        }
        close INPUT6;
        close OUTPUT6;

        move("degreenew_centrality.txt","$species")||warn "could not copy files :$!" ;
        move("closenessnew_centrality.txt","$species")||warn "could not copy files :$!" ;
        move("betweennessnew_centrality.txt","$species")||warn "could not copy files :$!" ;
        move("clusteringnew_coefficient.txt","$species")||warn "could not copy files :$!" ;

}
close INPUT;

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