Re: [PerlChina] Re: 急问！同样的程序不能say OUT到file但是可以say到screen这是为什么啊

没错，

use strict ; 肯定要

use warnings； 比-w更丰富，

 

对于特别大的文件， perl处理起来是有点慢

和你写的regex 或者写法有点关系， 比如很多行，然后你每行都有循环，当然慢，

也有可能是perl真的溢出了，你的数据量太大， 

use Math：：BigInt；  BigFloat等试试， 就是大数字

 

你最好多试试几种方法，看哪种效率高，  用while （ <> ) 逐行处理 还行，

 

 

2011/11/28 mandova <mandova1005@yahoo.cn>

恩，您说的写法我从来么见过。。。汗。。。我太菜了
-w 原来不等同于 use warnings啊~~
另外我想起一件事，就是我以前处理特别大的文件（几千万行）的时候输出文件也是会开始空白，要过一段时间才能打开，而且在程序停止很久才停止增
加。。。
然后我现在的问题就是，如果每个f都say了的话到第100多万个的时候会出现"-nan"...如果我用程序跑较小的染色体则不会出现这种情况。唉，
愁。

On 11月28日, 下午12时13分, Michael Zeng <galaxy2...@gmail.com> wrote:
> 提几个建议，
>
> 1） use strict;  use warnings ; 吧，编译的任何warning都是要注意的，
> 有可能你的loop这些程序没有抓到你想要的值，
>
> 2） 数组这个可以多用 ->   标示引用么， perl的2维数组全是引用，全写[] 看不清的，
>
> 3） 能写习惯的
> open my $F1, '>' , 'file" or die "XXXXX"  这样么， if这样看起来累，
>
> 我怀疑你 的loop比较多，要好好debug下，中间那段数组处理有的复杂，
> 你可以多say下看看，
>
> 2011/11/28 mandova <mandova1...@yahoo.cn>
>
>
>
>
>
> > 我刚才说，我两个say之间砍到while之后没有语句，while中什么都不做，就可以say OUT。。。另外，f[k]的长度>150w，我在检
> > 查的时候发现的第一个chromosome算f算到100万出头的时候就是-NaN了。。。~~~~(>_<)~~~~ that's
> > another problem...
>
> > On 11月28日, 上午9时56分, mandova <mandova1...@yahoo.cn> wrote:
> > > 天哪为什么是乱码。。。
>
> > > On 11月27日, 下午9时31分, cnhack TNT <cnhack...@gmail.com> wrote:
>
> > > > 额。。。麻烦多贴些相关代码成么? 不然要大家瞎子摸黑怎么个帮法儿？
> > > > 你都说了，砍掉一些语句就有输出了，那不就是你砍掉的语句有问题么，贴上来分析分析不就清楚了？
>
> > > > 2011/11/27 mandova <mandova1...@yahoo.cn>
>
> > > > > if(!open OUT,">","<文件名>" ) { die "..."; }
> > > > > 一直都是这样写的页没有出问题。。。程序一开始运行就应该有一个输出的，但是say
> > OUT没有，如果只是say就有在屏幕上。我把两个应该有输出的地
> > > > > 方之间的语句砍到一定程度就可以say OUT了。。。
>
> > > > > On 11月27日, 下午8时31分, 昨夜星尘 <chun191...@gmail.com> wrote:
> > > > > > 你的OUT是怎么定义的？定义错误也会出现这种情况。写文件用不了多少内存。
>
> > > > > > On 11月27日, 下午4时28分, mandova <mandova1...@yahoo.cn> wrote:
>
> > 我一直是这样写的，没有用过STDOUT，不知为什么这个程序就不行了。我试着把两个输出之间的语句减少看是否能够输出，答案是可以的（但是是没有任何
> > > > > > > 道理啊。。）
> > > > > > > 中间语句多到一定程度就不能写到文件里（文件始终为空），而我把OUT去掉就一直会持续地在屏幕上有输出。
> > > > > > > 我现在觉得是内存的问题。。。因为中间处理的数据很大。不了解写文件的动作要占用多少内存，似乎是压死骆驼的那最后一根稻草。。
>
> > > > > > > On 11月27日, 下午3时26分, Robin Lee <robinlee.s...@gmail.com> wrote:
>
> > > > > > > > 应该改成 STDOUT ？
>
> > > > > > > > 2011/11/27 mandova <mandova1...@yahoo.cn>
>
> > > > > > > > > 改成print也不行，文件打开没有报错，就是死活写不进文件啊~~~把OUT去掉就可以写在屏幕上。。。。- 隐藏被引用文字
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