2011年10月14日星期五

Re: [PerlChina] system 调用外部命令无法执行

改了,绝对路径也不行!

一松
2011/10/15 x2x4 <x2x4com@gmail.com>:
> 写绝对路径试试,一般我习惯
> my @return=`systemcommand 2>&1;echo \$?`
> 然后判断$return[-1]是否为0,否则就吧数组return输出
>
> 在 2011-10-15 上午11:29,"Yisong Zhen" <zhenyisong@gmail.com>写道:
>>
>> 没有什么额外的信息,只是说程序的第9行:
>> die cannot excute the proram: at temp.pl line 9.
>>
>> 一松
>>
>> 2011/10/15 Robin Lee <robinlee.sysu@gmail.com>:
>> > 改用
>> > die "cannot excute the proram: $!"
>> > 看看有什么系统错误信息
>> >
>> > 2011/10/15 Yisong Zhen <zhenyisong@gmail.com>:
>> >> 诸位,一个小问题:
>> >>
>> >> 该脚本运行在Fedora15上面:但是无法执行system里面的程序。但是,程序不用借助perl外部调用可以正确执行。
>> >> 即,我直接在linux命令行敲入:dialign2-2 -fn promoter.out -n promoter.seq
>> >> 可以执行程序。
>> >>
>> >> 起初我觉得是路径不对,我输出了路径,发现是正确的,而且所需的DIALIGN2_DIR变量也设置正确。
>> >> 代码如下:
>> >>
>> >> #!/usr/bin/perl
>> >>
>> >> #my $dir = $ENV{'DIALIGN2_DIR'};
>> >> #my $path = $ENV{'PATH'};
>> >>
>> >>
>> >> my $commandLine = "dialign2-2 -fn promoter.out -n promoter.seq";
>> >> my $returnValue = system($commandLine) || die "cannot excute the
>> >> proram";
>> >>
>> >> 非常感谢能有人出手帮助。
>> >>
>> >> 甄一松
>>
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