该脚本运行在Fedora15上面:但是无法执行system里面的程序。但是,程序不用借助perl外部调用可以正确执行。
即,我直接在linux命令行敲入:dialign2-2 -fn promoter.out -n promoter.seq
可以执行程序。
起初我觉得是路径不对,我输出了路径,发现是正确的,而且所需的DIALIGN2_DIR变量也设置正确。
代码如下:
#!/usr/bin/perl
#my $dir = $ENV{'DIALIGN2_DIR'};
#my $path = $ENV{'PATH'};
my $commandLine = "dialign2-2 -fn promoter.out -n promoter.seq";
my $returnValue = system($commandLine) || die "cannot excute the proram";
非常感谢能有人出手帮助。
甄一松
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