[PerlChina] Re: shebang行在Windows下也有用？

最近也在用perl写矩阵相关的脚本。觉得你的问题，用矩阵就可以实现了。
思路如下：
做一个循环，给每个DNA分组，若这个dna的所有target中只有一个为1（自己），那么这个组就只有自己；若这个dna的target中有多个
1，则检查target与group中的所有成员的score是否都为1，若是，加入group中，若不是，则不加入。
这个循环做下来，每个DNA都有了分组，删除那些冗余的分组，剩下都是独立的分组，再统计每组成员的个数，就完成了。

On 7月12日, 下午8时19分, jie liu <liujie....@gmail.com> wrote:
> 大家好！
>
> 我这有个最优化问题，是关于求最大子集的，想请大家帮我想想。
> 问题的具体情形是这样的：
> 有一种指标dG，它能描述两两单链DNA互补杂交的热力学特征。我现在有400条DNA(编号为0，2，3...399)，它们组成一个集合；我现在要从这个集 合中找到一个子集，这个子集里的任意两两DNA的dG值大于等于一个值（m=1）。因为符合这样条件的子集很多，我要找到含有最多DNA个数的那个子集。
> 我的方法是这样的：方便起见，400条DNA两两之间的dG，凡dG>=1的重新赋值为1，dG<1的重新赋值为0。我把这些值写入一个2维矩阵。如图1（见附 件）。含有最多1的那一行所代表的DNA被选出来，并且把所有与这个DNA杂交指标为1的其他DNA序列的相互关系写入一个新的2维矩阵，同时也会得到一个含有 最多1的那一行，把它选出来，重复上个运算。如此反复，最终筛选出来的DNA将组成最大子集。
> 我用perl写出来这个算法，但是当我扩大总DNA数时出现了问题：理论上，最大子集中DNA个数将不小于扩大之前的，但是实际上，情况相反。
> 请大家帮我看看，1）这个算法有问题吗？2）你能把你的办法写成伪代码告诉我吗？如果你能用perl写成源代码最好了。
>
> --
> Best regards,
> Liu Jie
>
> 020-32015312
> Guangzhou Institutes of Biomedicine and Health, Chinese Academy of Scienceshttp://www.gibh.cas.cn/
>
> matrix.txt
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>
> 图1.jpg
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