Re: [PerlChina] Re: 请教一个关于蛋白质序列的 perl语言程序

太热闹了，在Perl列表里谈论生物信息

2011/6/23 xiumu <yangyang445544@126.com>:
> 谢谢大伙了・・・・・・・・・让这个沉下去吧
>
> On 6月23日, 上午11时12分, xiumu <yangyang445...@126.com> wrote:
>> FASTA是生物信息数据库的常用存储方式，了解FASTA格式的含义，用perl编写程序分离注释行内容，分离蛋白质序列，并转变成氨基酸三字母表示
>> 方式。说明使用的perl数据结构和程序的变量转换过程，解释含义。
>>
>> 承认这是个作业・・・・・ 谢谢各位老大了・・・时间比较紧急 明天就交了・・・・・・ 程序于简单越好
>>
>> >1A23:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE >:注释行
>>
>> AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQA WAVAM
>> ALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFV NGKYQ
>> LNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK
>> 数据内容>1AAR:B|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
>>
>> MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRG G>1AG2:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
>>
>> GLGGYMLGSAMSRPMIHFGNDWEDRYYRENMYRYPNQVYYRPVDQYSNQNNFVHDCVNITIKQHTVTTTTKGENF TETDV
>> KMMERVVEQMCVTQYQKESQAYY>1AJ3:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
>>
>> AKLNESHRLHQFFRDMDDEESWIKEKKLLVSSEDYGRDLTGVQNLRKKHKRLEAELAAHEPAIQGVLDTGKKLSD DNTIG
>> KEEIQQRLAQFVDHWKELKQLAAARGQRLE>1ARR:B|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
>>
>> MKGMSKMPQFNLRWPREVLDLVRKVAEENGRSVNSEIYQRVMESFKKEGRIGA
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