Re: [PerlChina] 请教一个关于蛋白质序列的 perl语言程序

也许这个能解决你的问题 http://search.cpan.org/~cjfields/BioPerl-1.6.901/

PS.我没用过这个，你自己看文档了

2011/6/23 xiumu <yangyang445544@126.com>

FASTA是生物信息数据库的常用存储方式，了解FASTA格式的含义，用perl编写程序分离注释行内容，分离蛋白质序列，并转变成氨基酸三字母表示
方式。说明使用的perl数据结构和程序的变量转换过程，解释含义。

承认这是个作业・・・・・  谢谢各位老大了・・・时间比较紧急  明天就交了・・・・・・  程序于简单越好

>1A23:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE                                                   >:注释行
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAM
ALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQ
LNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK
数据内容
>1AAR:B|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG
>1AG2:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
GLGGYMLGSAMSRPMIHFGNDWEDRYYRENMYRYPNQVYYRPVDQYSNQNNFVHDCVNITIKQHTVTTTTKGENFTETDV
KMMERVVEQMCVTQYQKESQAYY
>1AJ3:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
AKLNESHRLHQFFRDMDDEESWIKEKKLLVSSEDYGRDLTGVQNLRKKHKRLEAELAAHEPAIQGVLDTGKKLSDDNTIG
KEEIQQRLAQFVDHWKELKQLAAARGQRLE
>1ARR:B|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
MKGMSKMPQFNLRWPREVLDLVRKVAEENGRSVNSEIYQRVMESFKKEGRIGA

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