2011年1月13日星期四

Re: [PerlChina] 求助一个正则表达式的问题

多谢你的建议，我大体搜了一下，找到了相关的信息。虽然目前我还看不太明白，不过至少给了我一个比较明确的方向。
再次感谢！

2011/1/13 伊现富 <yixf1986@gmail.com>
你这是GenBank的格式吧。
去CPAN上搜索一下bioperl中读取GenBank的包，看一下说明文档就可以用了。
对于处理公认格式的工具，别人早就写好了。

在 2011年1月13日 下午12:40，徐香� <shineway.x@foxmail.com>写道：

>gnl(.*$)
 
 
2011-01-13
徐香�
发件人： Fei Ni
发送时间： 2011-01-13  12:21:01
收件人： perlchina
抄送：
主题： [PerlChina] 求助一个正则表达式的问题
有一段文字：
<html>
<bodybgcolor=white>
<pre>
SSOURCE=<ahref="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Search&db=Nucleotide&doptcmdl=GenBank&term=AY013246">AY013246</a>
RELDATE=01-OCT-2002
ANN_TSD=1-5,5178-5182
ANN_LTR=6-208,4976-5177
PROTEIN=
>gnl|TREP|TREP22Retrotransposon,LTR,Copia,"RLC_Inav_AY013246-1";completeelement(5bpTSD)
CAACCTGTTAGACGAAATATCTCTTTGTATTATACGTGACTTGTATAACA
CGTATAGGTTAGGATCTCTTTCTATCTCCTTGTGTTTAAACCGTAGATAA
GATAGATTGATCTTAAACCTCTCCTCATGTATATCTCTTCGGCTTATGCT
GCCTATATAAATATGCACGCGTCCCTGCTAAGAGCATACGCTTCCAGCCT
TTCTCACATGGTATAAGAGCCACCTCTTCCATCGACATGTCATCTTCCTC
CTCAAGCTCCACCATGGCTGCCTCCCTCGCTGCGCTAGGTCACACCATAA
我想只拿到  >gnl 后面一直到文件结尾的文字（红色部分，结尾的文字不固定，可能是AGCT里的任意一个），用正则表达式该怎么去写呢？
非常感谢大家的热心帮助！！

PS1：本人刚接触Perl，正在看小骆驼书，是新手。
PS2：我花了至少一天的时间来写这个正则表达式，但一直没成功。

--
Feiny

Achieving dream takes time and patience.Great careers don't happen overnight ,and take years of hardwork.But every step along the road can get you closer to your dream.

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