Re: 一个基于位数组的序列覆盖率分析器 (Was Re: [PerlChina] Re: 在我遇到的这种情况下散列和数组哪个快？)

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agentzh wrote:

2009/9/23 agentzh <agentzh@gmail.com>:
>
> 今天晚些时候，我会提供一个 C++ 实现 ;)
>

刚刚写了一个 ANSI C++ 实现，呵呵，也不过 180 行代码，在 Linux 和 Win32 上进行了简单的测试。代码我作为 appears 项目放在了 GitHub 上面：

   http://github.com/agentzh/appears

如果没有 git 或者不熟悉 git，可以直接从下面的页面下载 v0.01 版的压缩包：

   http://github.com/agentzh/appears/downloads

解压后的编译和用法见 README 和 Makefile.

简单说来，在 Win32 上使用

  nmake -f NMakefile

来编译。然后用命令

  appears.exe input.txt

来分析输入文件 input.txt

在 Linux 上则直接

  make

程序用法是

 ./appears input.txt

为了测试方便，上面的项目构造过程还会生成 appears1 和 appears2 这两个程序，分别对应序列长度为 1 和 2 的情形（默认的 appears 对应 15）。

仅进行了简单的测试，欢迎同学们提供更彻底的基于 Perl 的测试集，哈哈！

在 Linux 利用 pmap 检查 appears 程序的内存占用情况：

total   134036K

果然只有 100 多 MB 的 RAM 占用，哈哈！

稍后，我得空了，再利用 Inline 模块封装为 Perl 可调用的形式，呵呵。

C++ 写得不好，欢迎大家指正 :)

Cheers,
-agentzh

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